《揚州大學學報（農業與生命科學版）》被國家科技部中國科技信息研究所、中國科學院文獻情報中心、北京大學圖書館分別入選為“中國科技論文統計源期刊即中國科技核心期刊” 、“中國科學核心期刊”、“全國中文核心期刊”。多次獲教育部”全國高校優秀科技期刊一等獎”及全國農業優秀期刊（學術類一等獎），蟬聯”江蘇省雙十佳期刊”，并獲首屆江蘇新聞出版政府獎（報刊獎），獲全國高校自然科學學報一等獎，是第二屆全國優秀科技期刊、第二屆江蘇省期刊方陣雙十佳期刊、Caj-cd規范獲獎期刊。