《福建農業學報》被以下數據庫和評價體系收錄

　　美國《化學文摘》(CA)

　　英國《國際農業與生物科學文摘》(CABI)

　　英國《全球健康文摘》(GH)

　　英國《動物學記錄》(ZR)

　　日本科學技術振興機構數據庫(JST)

　　聯合國糧農組織《國際農業文獻索引》(AGRIS)

　　中國科學引文數據庫(CSCD)(2023-2024)(2021-2022)(2019-2020)

　　《中文核心期刊要目總覽》2023年版(第十 版)、2020年版(第九版)、2017年版(第八版)、2014年版(第七版)

　　中國科技核心期刊(歷年)

　　RCCSE中國核心學術期刊

　　中國農林核心期刊(A類)

　　《福建農業學報》獲獎情況

　　福建省首屆優秀科技期刊獎(1992)

　　福建省第二屆優秀科技期刊二等獎(1996)

　　華東區首屆優秀期刊獎(1997)

　　全國首屆學術期刊CAJ-CD規范執行優秀獎(2000)

　　第三屆全國優秀農業期刊獎(2002)

　　第四屆全國優秀農業期刊二等獎(2004)

　　第五屆全國優秀農業期刊金犁獎(2006)

　　科學出版社期刊出版質量優秀獎(2015)